При Алексее Михайловиче монастырь стал пользоваться особым покровительством царя и его ближайших родственников. Рождение в 1672 г. царевича Петра, крещенного в честь тезоименитого святого апостола Петра, укрепила связь с монастырем Нарышкиных; после захоронения в 1682 г. в обители Ивана и Афанасии Нарышкиных, она стала родовой усыпальницей.
      Главным престольным праздником в монастыре в XVII-XVIII в. Всегда оставался день преставления Петра митрополита- 21 декабря; вторым по значению-24 августа-день перенесения его мощей. В 1680-1690-е гг. монастырь был возведен в собор Боголюбской иконы Божией Матери.
      Иконостасные и иконописные работы в «петровском» монастыре в середине 1680-х гг. были посвящены «новопостроенный» каменной церкви, которую в документах могли называть, «соборной, что у Петровских ворот» или во имя «Святых апостола Петра и Павла»; в эти же годы для храма Обители изготавливали предалтарную преграду, которую именовали в архивных источниках «Петровский иконостас».
      В документах этих лет «новопостроенный» храм именовали по-разному: церковь Петровского монастыря или монастырь во имя «Святых апостол Петра и Павла»; строившуюся же предалтарную преграду называли «Петровский иконостас».
       11 мая в 1686 г. именным указом велено было позолотить резной иконостас в Петровский монастырь под иконы местного яруса, а именно: киоты,тумбы, резные «столбы2, Царские врата, северные и южные двери.
      Вероятнее всего, речь шла о работах, которые были выполнены весной того же 1686г. мастерами по дереву с участием Лариона Юрьева.
      Итак, определенно можно сказать, что весной 1686г. силами мастеров по дереву и золотарей Оружейной палаты в Петровский монастырь был изготовлен резной золоченый иконостас под иконы местного ряда с Царскими вратами, а также северными и южными дверями. Однако, где именно была установлена эта предалтарная преграда, можно лишь строить предположения, поскольку в документах прямых ответов не содержится. Нельзя исключить, что конструкция послужила нижним ярусом предалтарной преграды, построенной в последние годы – 1688-1689гг.
      С 1688 г. монастырский «новопостроенный» храм в документах стали называть соборным.
      Есть все основания полагать, что Клим Михайлов с «товарищами» изготовили в конце 1680-х гг. в Петровский монастырь пятиярусную если учесть работы, связанные с созданием иконостаса под местные иконы 1686г.) или шестиярусную раму иконостаса.
      5 июля 1688 г. последовал указ Оружейной палаты о золочении для новопостроенный соборной церкви Петровского монастыря иконостаса, который изготовил подрядом Клим Михайлов с товарищами (1686/87) г., и о написании в него 54 икон.